Το Τμήμα Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων ιδρύθηκε το 1985 και προσφέρει προπτυχιακές σπουδές στο πεδίο της βιοϊατρικής τεχνολογίας.

Οι σπουδές περιλαμβάνουν μαθήματα βιοϊατρικής οργανολογίας και ιατρικής φυσικής, καθώς και μαθήματα υποδομής μηχανικών, όπως μηχανολογία, ηλεκτρολογία, ηλεκτρονική και πληροφορική. Το πρόγραμμα σπουδών επίσης περιλαμβάνει μαθήματα ιατρικής, βιολογίας, χημείας, μαθηματικών, διοίκησης επιχειρήσεων και οικονομίας.

Οι απόφοιτοι του τμήματος ονομάζονται Μηχανικοί Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων και απασχολούνται κυρίως σε εταιρείες βιοϊατρικής τεχνολογίας, σε ιδιωτικές κλινικές, σε δημόσια νοσοκομεία, σε ερευνητικά κέντρα και σε εκπαιδευτικά ιδρύματα. Η απορρόφηση των αποφοίτων στην αγορά εργασίας είναι πολύ υψηλή, ενώ περίπου 10% των αποφοίτων πραγματοποιεί μεταπτυχιακές ή/και διδακτορικές σπουδές σε Πανεπιστήμια της Ελλάδας ή του εξωτερικού.

Από το ακαδημαϊκό έτος 2007-08 το Τμήμα Τεχνολογίας Ιατρικών Οργάνων προσφέρει μεταπτυχιακές σπουδές στις Τεχνολογίες Πληροφορικής στην Ιατρική και τη Βιολογία, σε σύμπραξη με το Τμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών του Πανεπιστημίου Αθηνών και σε συνεργασία με το Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών της Ακαδημίας Αθηνών και με το Ινστιτούτο Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών του ΕΚΕΦΕ Δημόκριτος.

Πρόσφατα, το ΤΙΟ συνήψε συμφωνίες με ευρωπαϊκά πανεπιστήμια, για την ανταλλαγή φοιτητών και εκπαιδευτικού προσωπικού στα πλαίσια του προγράμματος Erasmus.